当前位置:网站首页 >> 南宁资讯 >> 职场学习 >> 科学大观 >> 正文

ESTs与基因识别

我要评论 来源:遗传博客  2008-6-4 0:46:00   浏览次数:
[导读]:EST技术最常见的用途是基因识别,传统的全基因组测序并不是发现基因最有效率的方法,这一方法显得即昂贵又费时。因为基因组中只有2%的序列编码蛋白质,因此一部分科学家支持首先对基因的转录产物进行大规模测序,即从真正编码蛋白质的mRNA出发,构建各种cDNA文库,并对库中的克隆进行大规模测序。Adams等提出的表达序列标签的概念标志着大规模cDNA测序时代的到来。虽然ESTs序列数据对不精确,精确度最高为97%,但实践证明EST技术可大大加速新基因的发现与研究。Medzhitov等通过果蝇黑胃TOLL蛋白进行dbEST数据库检索,该蛋白已证实在成熟果蝇抗真菌反应中发挥重要作用,通过同源分析的方法,找到相应的人类同源EST(登录号为H48602),这为接下来研究人类TOLL同源蛋白的功能提供了很
  est技术最常见的用途是基因识别,传统的全基因组测序并不是发现基因最有效率的方法,这一方法显得即昂贵又费时。因为基因组中只有2%的序列编码蛋白质,因此一部分科学家支持首先对基因的转录产物进行大规模测序,即从真正编码蛋白质的mrna出发,构建各种cdna文库,并对库中的克隆进行大规模测序。adams等提出的表达序列标签的概念标志着大规模cdna测序时代的到来。虽然ests序列数据对不精确,精确度最高为97%,但实践证明est技术可大大加速新基因的发现与研究。medzhitov等通过果蝇黑胃toll蛋白进行dbest数据库检索,该蛋白已证实在成熟果蝇抗真菌反应中发挥重要作用,通过同源分析的方法,找到相应的人类同源est(登录号为h48602),这为接下来研究人类toll同源蛋白的功能提供了很好的条件。hmsh5基因是从酿酒酵母菌msh5存在30%的一致性,它与hmsh4特异性相互作用,在减数分裂和精子发生过程中发挥一定的作用。由此可见,应用est技术,可以跳过生物分类学的界限,从生物模型的已识别基因迅速克隆出人和小鼠基因组相应的更复杂的未知基因。生物间在核苷酸水平上的进货差异阻碍了传统意义上的杂交或以pcr为基础的基因克隆策略,即使是亲缘关系很接近的生物也不例外,如c.elegans和c.briggsae,它们仅在2~5千万年前分化形成。而通过计算机进行dbest进行数据库筛选,其配制是电子杂交实验,提供了一条更为广泛的基因识别路线,这一路线允许基因组间存在差异,这使得基因识别与新基因克隆策略发生革命性变化,同时它也提供了一个足够大小和复杂的基因数据库,目前,ests数量正以平均每月10万条的速度递增。
分享到:
用户名: 密码: 匿名 登录 注册 忘记密码

注意:遵守《互联网资讯信息服务管理规定》,广告性质的评论会被删除,相关违规ID会被永久封杀。

验证码: 看不清楚,点此刷新! 查看评论